Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPRMP28827 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
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