Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PEX2P28328 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX2P28328 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX2P28328 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX2P28328 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX2P28328 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX2P28328 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX2P28328 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX2P28328 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PEX2P28328 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX2P28328 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX2P28328 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX2P28328 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX2P28328 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX2P28328 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX2P28328 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX2P28328 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PEX2P28328 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PEX2P28328 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms