Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD247P20963 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CD247P20963 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD247P20963 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms