Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMB1P20618 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB1P20618 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms