Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PGCP20142 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PGCP20142 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PGCP20142 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms