Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPCAMP16422 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms