Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSPP15924 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSPP15924 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DSPP15924 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSPP15924 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSPP15924 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSPP15924 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSPP15924 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSPP15924 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSPP15924 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSPP15924 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSPP15924 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DSPP15924 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DSPP15924 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSPP15924 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSPP15924 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DSPP15924 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSPP15924 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSPP15924 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSPP15924 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DSPP15924 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DSPP15924 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DSPP15924 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DSPP15924 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms