Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
IFITM1P13164 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms