Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ODC1P11926 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ODC1P11926 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ODC1P11926 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms