Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMIGD3P0DMS9 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms