Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CT47B1P0C2W7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CT47B1P0C2W7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms