Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HOXB7P09629 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms