Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RHOP08100 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RHOP08100 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOP08100 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOP08100 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOP08100 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOP08100 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOP08100 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOP08100 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOP08100 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOP08100 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOP08100 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOP08100 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOP08100 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOP08100 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOP08100 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOP08100 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOP08100 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOP08100 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOP08100 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RHOP08100 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms