Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB3P05106 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB3P05106 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms