Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APODP05090 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APODP05090 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APODP05090 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APODP05090 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APODP05090 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APODP05090 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APODP05090 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APODP05090 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APODP05090 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APODP05090 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APODP05090 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APODP05090 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APODP05090 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APODP05090 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APODP05090 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APODP05090 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APODP05090 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APODP05090 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APODP05090 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APODP05090 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APODP05090 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APODP05090 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APODP05090 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APODP05090 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APODP05090 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APODP05090 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APODP05090 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms