Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C6orf47O95873 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms