Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABARAPO95166 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABARAPO95166 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms