Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLIT2O94813 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLIT2O94813 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms