Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCO2O43819 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCO2O43819 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCO2O43819 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCO2O43819 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCO2O43819 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCO2O43819 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCO2O43819 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCO2O43819 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCO2O43819 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCO2O43819 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCO2O43819 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCO2O43819 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCO2O43819 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCO2O43819 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCO2O43819 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCO2O43819 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCO2O43819 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCO2O43819 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCO2O43819 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCO2O43819 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCO2O43819 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCO2O43819 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCO2O43819 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCO2O43819 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCO2O43819 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms