Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APAF1O14727 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APAF1O14727 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APAF1O14727 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APAF1O14727 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APAF1O14727 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APAF1O14727 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APAF1O14727 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APAF1O14727 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APAF1O14727 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APAF1O14727 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APAF1O14727 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APAF1O14727 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms