Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RGPD8O14715 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RGPD8O14715 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms