Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ERVH48-1M5A8F1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms