Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms