Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPIPA5E9PKD4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms