Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CCDC169A6NNP5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms