Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM221AA4D161 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms