Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX9Q9Y5X1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms