Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P9

SPEF1, Sperm flagellar protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF1Q9Y4P9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPEF1Q9Y4P9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPEF1Q9Y4P9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms