Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
KNSTRNQ9Y448 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNSTRNQ9Y448 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms