Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RCE1Q9Y256 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RCE1Q9Y256 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms