Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RNF6Q9Y252 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms