Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
IGSF9BQ9UPX0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms