Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms