Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK13

ZNF221, Zinc finger protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF221Q9UK13 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ZNF221Q9UK13 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms