Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CGGBP1Q9UFW8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms