Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGSF9Q9P2J2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms