Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC88CQ9P219 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC88CQ9P219 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms