Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DLL4Q9NR61 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms