Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ASCL3Q9NQ33 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms