Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ELL3Q9HB65 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ELL3Q9HB65 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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