Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ZYG11BQ9C0D3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms