Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRIM4Q9C037 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms