Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
APOL6Q9BWW8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms