Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 AC092068.1-201ENST00000592525 454 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSBP4Q9BWG4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SSBP4Q9BWG4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms