Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FYCO1Q9BQS8 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FYCO1Q9BQS8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms