Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGIP1Q9BQI5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGIP1Q9BQI5 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms