Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CSF3RQ99062 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms