Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CRBNQ96SW2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CRBNQ96SW2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms