Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCNX1Q96RV3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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