Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNFRSF13CQ96RJ3 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms